Предистория:
Действия происходят в промежутке после битвы Саске и восьмихвостого и нападения Пейна на Коноху.  Сейчас младший Учиха пребывает со своей командой в организации "Акацки", которая, по сведениям, потеряла большинство людей. Сейчас - Саске, Мадара и Пейн объединены, а новый состав "красной луны" таков:

Мадара; Саске; Пейн; Конан; Джууго; Суйгетсу; Карин

Зэтсу и Кисаме покинули Акатсуки, теперь этих двоих ничего не связывает с данной организацией, неизвестно, где сейчас они находятся. Новоиспечённые лидеры красной луны уже подыскивают новых членов организации, обращая внимание не только на силу, но ещё и разум, а так же склонность к различным видам техник. Дальнейшие их планы неизвестны, хотя ходят слухи, что Акацки, набрав нужное количество участников, собираются захватить несколько деревень, а затем уже выждать некоторое время и двинуться на Коноху, в поисках джинчуурики. Но это только слухи.
Наруто в то время только начинает осваивать режим мудреца, совершенно не осознавая, что грозит ему, его друзьям, и вообще - всему миру.